Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Neurl1bQ0MW30 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Neurl1bQ0MW30 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms