Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cnnm1Q0GA42 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms