Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cnn1Q08091 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn1Q08091 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms