Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col9a2Q07643 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms