Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprgQ05909 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprgQ05909 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprgQ05909 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprgQ05909 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprgQ05909 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprgQ05909 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprgQ05909 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms