Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Apoc2Q05020 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms