Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sox12Q04890 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms