Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpd1Q04519 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpd1Q04519 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms