Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Kcnb1Q03717 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnb1Q03717 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms