Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Crisp3Q03402 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms