Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hoxd1Q01822 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms