Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbp1Q01514 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms