Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms