Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rbp1Q00915 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms