Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Serpina1cQ00896 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms