Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
VegfaQ00731 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VegfaQ00731 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms