Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apoa1Q00623 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms