Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HmmrQ00547 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HmmrQ00547 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms