Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pax8Q00288 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms