Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Pou1f1Q00286 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Pou1f1Q00286 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Pou1f1Q00286 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Pou1f1Q00286 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pou1f1Q00286 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms