Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp9bP98195 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms