Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
rp9P97762 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
rp9P97762 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
rp9P97762 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
rp9P97762 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
rp9P97762 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
rp9P97762 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
rp9P97762 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
rp9P97762 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms