Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Bop1P97452 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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