Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Mesp1P97309 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Mesp1P97309 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms