Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Msx3P70354 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Msx3P70354 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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