Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smad1P70340 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms