Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux2P70298 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux2P70298 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux2P70298 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms