Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tubb4bP68372 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4bP68372 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms