Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl31P62900 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms