Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ElobP62869 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ElobP62869 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ElobP62869 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ElobP62869 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ElobP62869 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms