Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp46P62069 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp46P62069 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms