Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ppfia3P60469 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms