Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tpm2P58774 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms