Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Dpf3P58269 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpf3P58269 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpf3P58269 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms