Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TdgP56581 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TdgP56581 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TdgP56581 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms