Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NcanP55066 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NcanP55066 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NcanP55066 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NcanP55066 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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