Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms