Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClgnP52194 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ClgnP52194 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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