Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms