Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc13P50207 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms