Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BckdhaP50136 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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