Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Psen1P49769 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Psen1P49769 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Psen1P49769 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Psen1P49769 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Psen1P49769 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Psen1P49769 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Psen1P49769 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Psen1P49769 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Psen1P49769 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psen1P49769 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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