Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cox8bP48772 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms