Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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