Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms