Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cdkn1bP46414 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms