Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtgfrP43117 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms