Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl28P41105 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms