Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TfamP40630 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TfamP40630 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TfamP40630 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TfamP40630 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TfamP40630 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TfamP40630 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TfamP40630 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TfamP40630 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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TfamP40630 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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TfamP40630 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TfamP40630 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TfamP40630 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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