Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin1P35438 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin1P35438 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms